He probado todos los plugins disponibles para que los miniposts ajenos no salieran en la portada. El Ultimate Category Excluder daba problemas al listar las categorías y el resto de plugins quitaban los miniposts incluso de la barra lateral. Por suerte, las soluciones suelen ser mucho más sencillas. Pon el siguiente código antes del loop, sustituyendo el número de categoría por el que necesites, y asunto solucionado:

<?php
   if (is_home()) {
      query_posts($query_string . "&cat=-34");
   }
?>

Se ha corregido un bug que impedía moverse entre los artículos anteriores y posteriores.